تعتمد فلسفة المراكز الاستكشافية على التركيز على أن الإنسان هو صانع الحضارة وهو مكتشف القوانين ومبتكر التكنولوجيا، وأن هذه الحضارة والتكنولوجيا تحققت نتيجة تفاعل الإنسان مع ما يحيط به. إن الكون بما فيه بسماءه وأرضه هو المسرح الذى أعدّه الخالق سبحانه وتعالى ليمارس الإنسان دوره كخليفة يعمر الكون ويكتشف ويخترع ، هذه هى رسالة الإنسان على الأرض. وتعتبر سلسلة المراكز الاستكشافية التعليمية طليعة المتاحف التعليمية التجريبية في مصر، حيث تهتم برعاية الموهوبين فى العلوم وتنمية مواهبهم العلمية باعتبار أن هذه المواهب هى الرصيد المتبقى وفائض القيمة العلمية الحقيقى لنهضة مصر علمياً وتكنولوجياً.